L’Accordo Multiregionale per l'attuazione degli interventi cofinanziati dal FEP definisce le norme di funzionamento della Cabina di Regia.

Al fine di sviluppare le possibili sinergie, evitare distorsioni in sede di attuazione e garantire una coerente ed omogenea esecuzione delle misure previste dal Programma Operativo FEP, la Cabina di Regia svolge le seguenti funzioni:

• predisposizione di schemi-tipo di bandi di gara;
• coordinamento preventivo delle misure previste dai Piani di gestione nazionali e locali;
• definizione comune del Manuale di gestione e controllo e dei documenti preventivi e attuativi;
• informativa sulle modalità relative ai controlli di II livello;
• analisi di tematiche/problematiche sorte nel corso dell’attuazione;
• elaborazione di un Vademecum interpretativo a seguito dell’analisi di tematiche/problematiche sorte nel corso dell’attuazione;
• concertazione di modalità e procedure per la comunicazione delle irregolarità;
• monitoraggio dello stato di avanzamento del PO FEP e del piano finanziario ed eventuali compensazioni a seguito della verifica dei risultati di attuazione; 
• supporto alle riunioni del Comitato di Sorveglianza;
• eventuale individuazione di indicatori non previsti dal PO FEP;
• coordinamento per il monitoraggio della Valutazione Ambientale Strategica (VAS).